试管婴儿分为新鲜周期和解冻周期，自然周期移植是解冻周期的一种方案。它主要是针对于排卵正常的，患者能够自己排卵，在排卵以后，进行子宫内膜的转化解冻移植。它的过程是在月经的第10-12天监测卵泡，诱使卵泡长大，并且自然破裂以后，进行黄体酮支持2-3天，胚胎实验室把动溶的胚胎解冻，进行胚胎移植手术。这就是自然周期移植的过程。自然周期移植过程主要是针对排卵正常的人，而排卵不正常的患者是不能够选择自然周期解冻移植的。
从试管婴儿技术问世的那一天起，自然周期就是卵子准备的标准方案之一。随着医学对女性生殖内分泌机理的了解不断深入、一系列新型垂体/卵巢源激素（及其类似物）的问世，临床卵子准备方案逐步趋向于各型超促排卵方案，自然周期慢慢淡出了一线卵子准备方案行列。
正常女性一个自然月经周期中，会有一批卵子被募集并发育生长，但最终仅能排出一枚卵子。这枚卵子“历经磨难”（卵泡期FSH生理性降低）、“力压群芳”，最终脱颖而出。因此有理由相信，自然周期那枚唯一的卵子，是当个月经周期整批卵子中的“冠军卵”，由它形成的胚胎，当拥有最佳的发育潜能。从这个意义上讲，自然周期相对于超促排卵周期，进行了天然的胚胎选择。
从内分泌角度讲，自然周期对身体内分泌为零扰动（或接近零扰动）。避免了超促排卵周期因为使用各种激素给内分泌带来的不良影响，后者常常引起月经紊乱、体重增加等。这是自然周期另一个得天独厚的优势。结合“零促排卵药费”，在各种卵子准备方案中，自然周期拥有无以伦比的易接受性。
可是，事物总是两方面的。自然周期最大的缺点在于：低效率。一个周期一枚主卵泡，存在着取卵失败（得不到卵子）、卵子异常、受精失败、卵裂失败等一道道关卡。尤其是对取卵时机的判断，是自然周期最大的难点。
